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分子互作資料

Fret熒光共振能量轉(zhuǎn)移

Fret 熒光共振能量轉(zhuǎn)移

對于分子生物學(xué)來講,生物分析手段的發(fā)展,是闡明機(jī)理的必要條件。在研究分子間相互作用的道路上,人們不斷      探索,總結(jié)出很多方法,免疫技術(shù),晶體衍射,核磁共振等。1948 年,熒光共振能量轉(zhuǎn)移(Fluorescence resonance energy transfer,F(xiàn)RET)理論被首次提出,它可以測定 1.0-6.0nm 距離內(nèi)分子間的相互作用。1967 年,這一理論得到了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,將 1.0-6.0nm 的距離稱為光學(xué)尺。二十世紀(jì)八十年代出,通過科學(xué)家的不斷探索,F(xiàn)ret 技術(shù)成功運(yùn)用到蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的研究中。自 Fret 熒光共振能量技術(shù)誕生以來,已結(jié)合多種先進(jìn)的技術(shù)和方法,如電子顯微鏡,X 射線衍射等,推動了分子生物學(xué)檢測手段的發(fā)展。

作用原理
熒光共振能量轉(zhuǎn)移技術(shù),是采用物理方法去檢測分子間的相互作用的方法。   他適用于在細(xì)胞正常的生理?xiàng)l件下,驗(yàn)證已知分子間是否存在相互作用。此方法的檢測原理如下;

將我們要檢測的蛋白(如圖 X 和Y),分別偶聯(lián)上 D 和A 熒光蛋白,D 和A 是一對熒光物質(zhì),我們稱之為供體(donor)和受體(acceptor)。當(dāng)用 430nm 的紫光去激發(fā) X 融合蛋白時(shí),它能夠產(chǎn)生 490nm 的藍(lán)色熒光;同樣,當(dāng)我們用 490nm 的藍(lán)光去激發(fā) Y 融合蛋白時(shí),它能夠產(chǎn)生 530nm 的黃色熒光。(結(jié)合圖 1) 。

當(dāng)?shù)鞍?X 和 Y 間沒有相互作用時(shí)(兩者的空間距離>10nm),融合蛋白 X 和 Y 分別產(chǎn)生相應(yīng)的熒光而被檢測到,如果蛋白 X 和 Y 間存在相互作用(兩者的空間距離需<10nm,結(jié)合圖 2),用紫光激發(fā)融合蛋白 X 其產(chǎn)生的藍(lán)光會被融合蛋白Y 吸收,從而產(chǎn)生黃色熒光,這時(shí),在細(xì)胞內(nèi)將檢測不到藍(lán)色熒光的存在。這時(shí)因?yàn)槟芰繌?X 融合蛋白轉(zhuǎn)移到了 Y 融合蛋白,這就是熒光共振能量轉(zhuǎn)移技術(shù)。

技術(shù)難點(diǎn)
一個(gè)理想的 Fret 相互作用體系,要求要有一對合適的熒光物質(zhì), 即供體的發(fā)射光譜與受體的吸收光譜有明顯的重疊。且當(dāng)供體的激發(fā)波長時(shí)對受體無影響,供體和受體的發(fā)射光譜要完全分開,否則容易造成光譜干涉,而使反應(yīng)      體系不穩(wěn)定。目前,較為常用的供體-受體分子對,主要有綠色熒光蛋白類(GFPs)和染料類。綠色熒光蛋白類有CFP-YFP,BFP-GFP,BFP-YFP 等,染料類的有 Cy3-Cy5,F(xiàn)ITC-Rhodamine 等。且這些熒光物質(zhì)要能夠標(biāo)記在研究對象上。

應(yīng)用要求
供體熒光基團(tuán)和受體熒光基團(tuán)的空間距離要<10nm; 供體的發(fā)射光譜與受體的接收光譜有相當(dāng)?shù)闹丿B;
供體、受體分子在量子產(chǎn)率、消光系數(shù)、水溶性、抗干擾能力等方面要求較高。

優(yōu)缺點(diǎn)

優(yōu)點(diǎn)

缺點(diǎn)

在活細(xì)胞的正常生理?xiàng)l件下進(jìn)行檢測,觀察大分子在細(xì) 胞內(nèi)的構(gòu)象變化與相互作用,并彌補(bǔ)了需破碎細(xì)胞檢測 相互作用的缺點(diǎn);靈敏度高,可實(shí)現(xiàn)對單細(xì)胞水平的研究,研究單個(gè)受體 分子;可與多種儀器和技術(shù)結(jié)合使用,如顯微鏡,色譜技術(shù),電泳,流失細(xì)胞技術(shù)等;

應(yīng)用比較局限,一般需要在待檢測分子上偶聯(lián)熒光物質(zhì)(加上記);
對實(shí)驗(yàn)要求較高,如供受體的光譜重疊不好,會導(dǎo)致熒 光干擾,對供受體的抗干擾能力,水溶性等要求高; 需要不斷探索合適的供體和受體,且能夠標(biāo)記分子; 難以觀察瞬時(shí)的分子間作用,檢測要求大量的樣品;

應(yīng)用

  • 細(xì)胞內(nèi)分子間的相互作用

  • 膜蛋白的研究

  • 細(xì)胞膜受體蛋白間的相互作用

  • 細(xì)胞凋亡的研究

  • 核酸檢測

實(shí)驗(yàn)流程簡述

  • 以熒光物質(zhì) CFP(供體)-YFP(受體)為例,檢測 AB 蛋白在細(xì)胞內(nèi)的相互作用。

  • 1.細(xì)胞培養(yǎng):根據(jù)實(shí)驗(yàn)培養(yǎng)特定的細(xì)胞用于轉(zhuǎn)染,觀察檢測分子在細(xì)胞內(nèi)的相互作用;

  • 2.細(xì)胞轉(zhuǎn)染:構(gòu)建質(zhì)粒載體 CFP-A 和 YFP-B,將檢測的 AB 蛋白分別偶聯(lián)上熒光蛋白 CFP 和 YFP,并將兩個(gè)質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染到培養(yǎng)的細(xì)胞內(nèi);

  • 3.檢測 FRET:質(zhì)粒載體 CFP-A 和 YFP-B 轉(zhuǎn)染細(xì)胞 10h、12h、18h、24h、36h、48h、72h 后檢測,是否發(fā)生 Fret;

  • 4.FRET 圖像采集: 確定 FRET 配對的激發(fā)波長, 藍(lán)光被調(diào)諧分別用于探測最大和最小的供體和受體信號, 最大供體信號和最小受體信號對應(yīng)的波長用于收集雙表達(dá)細(xì)胞的 FRET 信號。調(diào)整激光變化,以便獲取最大 CFP 信號和最小 YFP 信號的激發(fā)光波長,采集供體和受體圖像,收集 FRET 信號。每個(gè)細(xì)胞 FRET 檢測重復(fù) 3 次,每種轉(zhuǎn)染至少完成 6 個(gè)細(xì)胞的 FRET 檢測;

  • 5.FRET 數(shù)據(jù)處理: 去除 FRET 信號中 DSBT 和 ASBT 的光譜串色信號; 受體通路的 FRET 信號需要對

  • 供體受體光譜靈敏度的變化進(jìn)行矯正、對自發(fā)熒光和光學(xué)噪聲進(jìn)行矯正; 利用矯正系數(shù)對雙標(biāo)定細(xì)胞進(jìn)行象素匹配矯正。